凈化工作臺(tái)有許多可能的配置。為特定的應(yīng)用理想的環(huán)境將需要仔細(xì)考慮氣流，工作臺(tái)設(shè)計(jì)和過濾選項(xiàng)。

層流方向

垂直和水平氣流工作臺(tái)在保持物體不受污染方面各有優(yōu)缺點(diǎn)。面臨的挑戰(zhàn)是，當(dāng)將物體放置在氣流中時(shí)，它的空氣動(dòng)力學(xué)不是很理想，并且會(huì)阻塞一些氣流，從而在其周圍產(chǎn)生湍流。在有湍流的地方，空氣交換速率降低，并且可能與相鄰的氣流混合。湍流會(huì)向下延伸來(lái)自物體的空氣蒸汽。然后，來(lái)自湍流區(qū)域的能量可以將空氣吸回上游，朝向物體。

水平流  

當(dāng)工件具有大的水平表面和/或垂直于氣流的狹窄橫截面時(shí)，水平氣流通常是比較好的。水平氣流也非常適合個(gè)人直接在工件上方工作的應(yīng)用。在水平流動(dòng)的凈化工作臺(tái)上，工作對(duì)象與工人的手或儀器之間始終保持清潔的氣流。當(dāng)使用標(biāo)準(zhǔn)氣流速度為90 LFPM（每分鐘線性英尺）且工作區(qū)域?yàn)?0英寸的凈工作臺(tái)時(shí)，進(jìn)行完整的空氣交換所需的時(shí)間不到兩秒鐘。典型的水平層流工作站具有桌面和三面罩。HEPA過濾器位于工作表面的垂直后側(cè)，容易損壞。有時(shí)需要使用輔助格柵來(lái)保護(hù)過濾器。

垂直流

出于多種原因使用垂直流，但是主要考慮對(duì)象的大小和類型。大物體會(huì)阻塞水平層流工作站中的氣流，從而在物體的下游側(cè)產(chǎn)生大面積的湍流。這些湍流區(qū)域通常在吸入周圍空氣時(shí)被污染。在垂直流動(dòng)下，空氣從頂部進(jìn)入工作區(qū)域并向下流動(dòng)，從而圍繞工作區(qū)域內(nèi)的物體。空氣在前后，左右流動(dòng)，并用干凈的過濾空氣在各個(gè)方向上沖洗物體。